Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITCHQ96J02 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITCHQ96J02 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITCHQ96J02 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms