Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHDQ96IW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms