Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALML4Q96GE6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CALML4Q96GE6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALML4Q96GE6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms