Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms