Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms