Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC51Q96ER9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC51Q96ER9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms