Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTERF3Q96E29 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms