Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM44Q96DX7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms