Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC5Q96DU9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC5Q96DU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms