Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms