Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1LQ96C74 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms