Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC127Q96BQ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC127Q96BQ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC127Q96BQ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms