Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPS3Q969F9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms