Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF4BQ92750 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4BQ92750 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms