Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP205Q92621 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP205Q92621 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP205Q92621 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms