Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1Q8WVP7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBR1Q8WVP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBR1Q8WVP7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms