Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSC4DQ8WTU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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