Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms