Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VANGL1Q8TAA9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VANGL1Q8TAA9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VANGL1Q8TAA9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms