Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLHC1Q8NHS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLHC1Q8NHS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms