Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TTLL11Q8NHH1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL11Q8NHH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL11Q8NHH1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL11Q8NHH1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms