Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE22Q8NFJ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms