Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP32Q8NFA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP32Q8NFA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP32Q8NFA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms