Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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