Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOF1Q8ND07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOF1Q8ND07 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms