Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARRDC4Q8NCT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARRDC4Q8NCT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARRDC4Q8NCT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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