Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM35BQ8NCS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM35BQ8NCS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms