Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM87AQ8NBN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms