Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KBTBD3Q8NAB2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KBTBD3Q8NAB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KBTBD3Q8NAB2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms