Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNBD1Q8NA66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms