Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSGALNACT2Q8N6G5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms