Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN19Q8N6F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN19Q8N6F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms