Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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