Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC43Q8N309 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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