Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC170Q8IYT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms