Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms