Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIX1LQ8IVB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIX1LQ8IVB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIX1LQ8IVB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms