Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPBP1Q86WP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPBP1Q86WP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPBP1Q86WP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPBP1Q86WP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPBP1Q86WP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms