Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCA5Q86VQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCA5Q86VQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms