Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF39Q86UA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF39Q86UA1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms