Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP54Q7Z3B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms