Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2AQ7L0J3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms