Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM5Q71RC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM5Q71RC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms