Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms