Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFLNAQ6ZTI6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFLNAQ6ZTI6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFLNAQ6ZTI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFLNAQ6ZTI6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms