Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC141Q6ZP82 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
CCDC141Q6ZP82 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC141Q6ZP82 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms