Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP6Q6ZN66 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms