Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO4Q6UY18 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms