Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VITQ6UXI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms