Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBSNQ6UWP8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBSNQ6UWP8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms